После отъезда из Петербурга семья Набоковых никогда не имела собственного жилья. Дом на Большой Морской остался для писателя «единственным в мире домом». Через пятьдесят лет после расставания с домом детства и юности Набоков возвратился в него в своем автобиографическом романе «Другие берега», описав внешние приметы дома и образ жизни его обитателей.

Музей в Петербурге является единственным в мире музеем, посвящённым творчеству и жизни Владимира Владимировича Набокова. Музейная экспозиция расположена в нескольких комнатах трёхэтажного особняка в стиле раннего модерна, который принадлежал Набоковым с 1898 г. На первом этаже дома сохранились интерьеры столовой и библиотеки в стиле Людвига XV. Также ведутся работы по реставрации изысканного интерьера зелёной гостиной.

Основу музейной коллекции составляют личные вещи писателя, предметы, связанные с историей особняка и семьи Набоковых, первые издания произведений автора, а также обширная научная библиотека. В музее выставлена уникальная коллекции бабочек писателя, аналогов которой нет в России на сегодняшний день.